Agjencia e Inteligjencës dhe Sigurisë së Mbrojtjes (AISM)
Agjencia e Inteligjencës dhe Sigurisë së Mbrojtjes (AISM) është institucion i cili organizohet dhe funksionon në mënyrë të centralizuar, si strukturë në nivel drejtorie të përgjithshme në Ministrinë e Mbrojtjes, me struktura varësie në territoret ku kryejnë veprimtarinë Forcat e Armatosura, brenda dhe jashtë vendit sipas zonave të përgjegjësisë dhe zonave të interesit.
Agjencia Kombëtare e Mbrojtjes Civile (AKMC)
Agjencia Kombëtare e Mbrojtjes Civile (AKMC) është pjesë përbërëse e strukturës së Ministrisë së Mbrojtjes. Agjencia Kombëtare e Mbrojtjes Civile është strukturë përgjegjëse për zvogëlimin e riskut nga fatkeqësitë dhe mbrojtjen civile, në të gjithë territorin e Republikës së Shqipërisë..
Arkivi i FA (AQFA)
Arkivi Qendror i Forcave të Armatosura (AQFA) varet nga Ministria e Mbrojtjes. Ai ka bashkëpunim metodologjik - profesional me Drejtorinë e Përgjithshme të Arkivave të Shtetit të Republikës së Shqipërisë.
Autoriteti i Kontrollit Shtetëror të Eksporteve (AKSHE)
Autoriteti i Kontrollit Shtetëror të Eksporteve (AKSHE) është një institucion qëndror, me statusin e personit juridik, publik, në varësi të Ministrit të Mbrojtjes, i cili ka si objekt të veprimtarisë kontrollin shtetëror mbi eksportin, importin, kalimin tranzit, transferimin dhe veprimtaritë ndërmjetësuese për mallrat ushtarake dhe mallrat e teknologjitë me përdorim të dyfishtë.
Drejtoria e Përgjithshme e Rezervave Materiale të Shtetit
Rezervat materiale të shtetit krijohen për të ndërhyrë, në mënyrë operative, për mbrojtjen e popullsisë, të ekonomisë dhe mbrojtjen e vendit, në situata të gjendjes së jashtëzakonshme, gjendjes së emergjencës civile, veprimeve terroriste, veprimeve ushtarake ( në gjëndje lufte), të cilat sjellin dëme të menjëhershme e të rënda për jetën, për shëndetin e popullatës dhe të gjësë së gjallë, për pasurinë, për trashëgiminë kulturore dhe për mjedisin.
Drejtoria e Shifrës
.............
Instituti i Gjeografisë dhe Infrastrukturës Ushtarake
Instituti i Gjeografisë dhe Infrastrukturës Ushtarake (IGJIU), harton normat e projektimit për ndërtime specifike në Forcat e Armatosura të Republikës së Shqipërisë. Ky institucion kryen oponencën teknike për projektet dhe ndërtimet dhe bashkëpunon me institucione të ndryshme brenda dhe jashtë vendit.
Military Export Import Company (MEICO)
Military Export Import Company (MEICO) është ndërmarje shtetërore në varësi të Ministrisë së Mbrojtjes. Kjo ndërmarje është krijuar në vitin 1991 dhe që nga ky vit ushtron veprimtarinë dhe aktivitetin e saj për plotësimin e nevojave të Forcave të Armatosura shqiptare dhe të institucioneve të tjera me mallra importi specifike të karakterit ushtarak, si dhe eksporte të mallrave ushtarake të reja dhe stoqeve të ushtrisë shqiptare, si dhe të prodhimeve të industrisë ushtarake.
Njësia Mjekësore Ushtarake
.............
Përfaqësitë Ushtarake Jashtë Vendit
.............
Qendra e Kulturës, Medias, Botimeve të Mbrojtjes, Muzeut të Forcave të Armatosura (QKMBMMFA)
Qendra e Kulturës, Medias, Botimeve të Mbrojtjes, Muzeut të FA është nën varësinë administrative e funksionale të ministrit të Mbrojtjes. Për përmbushjen e misionit dhe detyrave të saj, në shërbim të Forcave të Armatosura, qendra merr dhe zbaton detyra edhe nga shefi i Shtabit të Përgjithshëm në raste situatash emergjente. Qendra përbëhet nga: Drejtoria e Kulturës, Medias dhe Botimeve si edhe Muzeu Ushtarak i FA.
Muzeu i Forcave të Armatosura
Qendra Kombëtare e Kërkim-Shpëtimit (QKKSH)
Qendra Kombëtare e Kërkim-Shpëtimit (QKKSH) është person juridik publik, në varësi të Ministrit të Mbrojtjes, dhe ka si qëllim planëzimin, organizimin, koordinimin dhe kryerjen e operacioneve të kërkim-shpëtimit në Republikën e Shqipërisë. Ajo siguron koordinimin e përgjithshëm të operacioneve të shërbimit të kërkim-shpëtimit dhe mban kontakte të drejtpërdrejta me shërbimet homologe të shteteve të tjera. Qendra Kombëtare e Kërkim-Shpëtimit (QKKSH kryen edhe rolin e Qendrës së Koordinimit të Shpëtimit (RCC).
Qendra Ndërinstitucionale Operacionale Detare (QNOD)
Qendra Ndërinstitucionale Operacionale Detare (QNOD) është një institucion ndërdikasterial që ka për detyrë të sigurojë vëzhgimin e hapësirës detare shqiptare, për të realizuar organizimin, planëzimin, bashkërendimin dhe drejtimin e operacioneve në det, në përputhje me legjislacionin detar kombëtar dhe ndërkombëtar.
